はい、可能です。
ユーザーカスタム属性の設定画面にある「フロントへの表示」設定を「無効」にすることで、管理画面からのみ参照・編集できる項目として運用いただけます。
社員番号や内部的な識別子など、「ユーザーには非表示にし、管理者側だけで管理したい」場合は、以下の設定を組み合わせてください。
「フロントへの表示」と「アプリからの入力」の両方を無効にすることで、完全な内部管理用項目になります。
フロントへの表示：無効
ユーザープロフィール等の画面に項目が表示されなくなります。
アプリからの入力：無効
ユーザー本人が値を入力・編集できなくなります。
管理画面の［ユーザーカスタム属性］メニューを開きます。
対象の属性の「︙」をクリックし、「編集する」を選択します。
「フロントへの表示」 を 無効 に切り替えます。
（任意）ユーザーに編集させない場合は 「アプリからの入力」 も 無効 にします。
［更新］ボタンをクリックして完了です。